식물생태학실험 | Ordination

TIP

 

 

CANOCO 프로그램을 이용해 생태학적인 서열화 분석법에 대해 간략히 이해해본다.

 

 

 

군생태학(community ecology)에서는 종(species), 장소(sites) 그리고 환경변수(environmental variables) 사이의 관계를 규명함으로써, 어느 한 종이 어떤 환경과 어떤 장소에 적합한지 살펴보고, 환경인자의 동적 변화에 따라 종의 분포가 어떻게 변화하는지 예측하는데 높은 연구관심을 두고 있다. 이러한 목적을 위해 군생태학에서는 서열화방법(ordination method)을 사용하는데, 서열화방법은 환경변수의 유무에 따라 서열분석(ordination analysis) 및 정준서열분석(canonical ordination analysis)으로 구분된다.

 

서열분석은 종별 분포를 대표할 수 있는 일정한 크기의 표본 추출된 장소에서 종별 출현빈도를 조사한 자료를 이용하여 종과 장소의 연관성을 보고자 하는 분석으로, Bray와 Curtis가 극점서열분석(polar ordination)을 소개한 후 군생태학에서 널리 활용되고 있다.

 

Ter Braak (1986)의 정준대응분석(canonical correspondence analysis)이 제시되기 이전의 서열분석에서는 환경 정보가 없는 종-발현 자료만으로 가상의 잠재변수를 도출한 후 이를 간접적 환경인자로 놓고 종 출현과 환경과의 관계를 규명하고자 하였다. 이를 간접 서열화(indirect ordination) 분석이라 한다. 그런데, 이런 잠재적 환경 인자는 여러 환경변수들이 혼재 된 결과로 보이기에 자료 해석에 어려움이 존재한다. 간접 서열화 분석으로는 주성분분석(principal component analysis; PCA), 대응분석(correspondence analysis; CA) 등을 들 수 있다.

 

정준서열분석은 서열분석에 사용된 자료에 환경인자에 대한 추가적인 정보가 주어질 때 사용할 수 있는 방법이다. 이 분석법은 서열분석에 비해 조사된 자료의 종과 장소의 관계를 그림 상에 완전 유사하게 나타낼 수는 없지만, 환경변수와의 연관관계를 직접적으로 표현할 수 있기 때문에 매우 유용한 분석으로 알려진다.

 

정준서열분석에는 중복분석(redundancy analysis; RDA), 정준대응분석(canonical correspondence analysis; CCA) 등이 있다. 특히, Ter Braak (1986)의 정준대응분석은 환경변화에 따른 종분포를 잘 나타내주기 때문에 최근까지 가장 널리 사용되고 있는 서열화방법이다.

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실험 방법

1. 자료를 CANOCO 프로그램에서 사용할 수 있도록 변환

1) 각 조사구에서 나오는 종별 중요치를 엑셀 시트에 입력 (행: 종, 열: 조사구)

 

2) 입력된 자료의 범위를 선택하여 Ctrl+C로 클립보드에 복사

 

3) WCanoImp 실행

 

4) Each column is a Sample 체크하고 Save 클릭하여 data 파일 생성

 

2. Ordination 분석

1) Canoco for window 5 실행

 

2) File/New project 메뉴 실행

 

3) Only species data available 선택하고 Next 클릭

 

4) Species data file name에 생성해 놓은 Data 파일명, Canoco solution file name에 분석 결과를 저장할 파일명 입력 후 Next 클릭

 

5) DCA 선택하고 Next 클릭

 

6) By segments 선택하고 Next 클릭

 

7) Do not transform 선택하고 Next 클릭

 

8) 아무것도 선택하지 않고 Next 클릭

 

9) Finish 클릭하고 프로젝트 파일이름 입력

 

 

 

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